牡丹种子是由子房内的胚珠发育而成的，一般在每年的8月上、中旬成熟，结实率因雌雄蕊的瓣化程度增高而降低，甚至不结实，种子在达到一定成熟度后，其萌芽率随成熟度提高而降低。播种时期晚了。牡丹种子的上胚轴具有休眠的特性，在7月下旬至8月上中旬即可采收，宜即采即播，过早过晚会降低发芽率。我估计你的种子存放太久可能发芽率已经太低了。
牡丹花种植种子繁殖有个缺点就是开花晚，衡水土壤有点碱。牡丹花的繁殖，用播种法、分株法、嫁接法都可以。但用播种法时间太长，从播种时起，要4-5年后方可见花;衡水的牡丹长寿的少，新手更是难以伺候，若措施不当，即使发芽后牡丹也难以成长，所以牡丹花种子种植方法是最难的，所以一般以采用分株法者为多。
种植过程中牡丹播种不可过深，以3至4厘米为宜，播后覆土与地面平，俗称“种子入土，深不过五”(5厘米)。再轻轻将土壤踏实，浇透水，冬季要覆上谷草、树叶或马粪，或用地膜盖好，以保温、保墒、防寒。翌年牡丹萌动出土后，使幼苗露出地面，弱者仅生出一片小叶，壮者可生出2至3片叶，应及时中耕除草。
牡丹为深根性落叶灌木花卉，性喜阳光，耐寒，爱凉爽环境而忌高温闷热，适宜于疏松、肥沃、排水良好的砂质土壤中生长。它有一定抗旱能力而不耐潮湿，忌栽植于积水的低洼处，若土壤中水分过多，其肉质根部容易腐烂。牡丹的特性是“四宜四怕”，即宜凉怕冻，宜暖怕热，宜光怕阴，宜干怕湿。因此，种植牡丹要选宽敞通风、上午有阳光、土壤肥沃疏松的地方，不可种在积水地、阴湿地、瓦砾地。