牡丹的病虫害主要有：灰霉病、褐斑病、炭疽病、轮斑病、枝枯病、根结线虫病。
一、牡丹花灰霉病的危害
灰霉病是世界上牡丹的重要病害之一，在我国也时有发生，上海、郑州等地较严重。该病在牡丹的生长季节均可发生，对幼嫩植株危害严重，引起幼苗的倒伏、枯萎。
牡丹花灰霉病防治方法
方法一、减少侵染来源：秋季病株的枯枝落叶，春季发病时摘除病芽、病叶，对病残体进行深埋处理。
方法二、生长季节化学防治：生长季节一旦发病可采用下列药剂进行喷雾防治：1%石灰等量式波尔多液，70%甲基托布津1000倍液，65%代森锌500倍液，或50%氯硝胺1000倍液。每隔10天-15天喷1次，连续喷2次-3次。
方法三、加强栽培管理：栽植密度要适度;雨后及时排水，株丛基部不要培湿土;重病区要实行轮作;栽植无病种苗，苗木可用65%代森锌300倍液浸泡10-15分钟。
二、牡丹花褐斑病危害
褐斑病又叫红斑病，是牡丹常发生的世界性病害。常引起叶片早枯，影响牡丹的生长势。
牡丹花褐斑病的防治方法
方法一、减少侵染来源：秋季彻底地上的病残体;早春植株萌动前喷50%多菌灵600倍液或3度的石硫合剂，杀灭植株上的病菌。
方法二、生长季节的化学防治中：发病后喷50%多菌灵1000倍液，或65%代森锌500-600倍液，7天-10天喷1次，连续喷3次-4次。
方法三、加强栽培管理：栽植密度适度，施有机肥及复合肥。